Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Atp8b1Q148W0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp8b1Q148W0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms