Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne7Q0VE82 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms