Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms