Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcn1Q05186 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcn1Q05186 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms