Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms