Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp1Q01514 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms