Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb1Q00420 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms