Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms