Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb1P70662 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms