Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp9xP70398 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms