Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd6P61407 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms