Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2fP61219 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms