Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1bbP56400 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms