Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pex2P55098 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms