Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Aqp4P55088 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms