Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcnfP51944 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 778.8 ms