Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CratP47934 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CratP47934 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CratP47934 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CratP47934 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CratP47934 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CratP47934 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CratP47934 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CratP47934 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CratP47934 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CratP47934 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CratP47934 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CratP47934 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CratP47934 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CratP47934 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms