Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx1P43345 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms