Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpargP37238 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpargP37238 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpargP37238 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpargP37238 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpargP37238 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpargP37238 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpargP37238 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpargP37238 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpargP37238 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpargP37238 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpargP37238 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpargP37238 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpargP37238 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpargP37238 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms