Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab21P35282 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab21P35282 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab21P35282 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab21P35282 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab21P35282 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms