Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms