Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RxrbP28704 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrbP28704 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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