Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjc1P28229 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms