Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tsta3P23591 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms