Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ggta1P23336 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ggta1P23336 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ggta1P23336 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ggta1P23336 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ggta1P23336 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ggta1P23336 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ggta1P23336 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ggta1P23336 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ggta1P23336 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ggta1P23336 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ggta1P23336 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ggta1P23336 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ggta1P23336 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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