Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja1P23242 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms