Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klra1P20937 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Klra1P20937 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klra1P20937 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klra1P20937 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klra1P20937 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klra1P20937 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klra1P20937 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klra1P20937 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klra1P20937 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klra1P20937 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klra1P20937 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klra1P20937 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms