Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfaP20033 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms