Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18526 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18526 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18526 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms