Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolP11369 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolP11369 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolP11369 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolP11369 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolP11369 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolP11369 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolP11369 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolP11369 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolP11369 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PolP11369 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP11369 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms