Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gap43P06837 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gap43P06837 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gap43P06837 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gap43P06837 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gap43P06837 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gap43P06837 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gap43P06837 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gap43P06837 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gap43P06837 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms