Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfrbP05622 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms