Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01635 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01635 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01635 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01635 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01635 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01635 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01635 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01635 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01635 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01635 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01635 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01635 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01635 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01635 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01635 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01635 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01635 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01635 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01635 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01635 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms