Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccl20O89093 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccl20O89093 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccl20O89093 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccl20O89093 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccl20O89093 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccl20O89093 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccl20O89093 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccl20O89093 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccl20O89093 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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