Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nme6O88425 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nme6O88425 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme6O88425 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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