Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ptpn20O55082 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ptpn20O55082 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ptpn20O55082 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ptpn20O55082 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ptpn20O55082 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ptpn20O55082 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ptpn20O55082 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptpn20O55082 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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