Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbrO54799 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms