Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EdaO54693 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EdaO54693 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EdaO54693 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EdaO54693 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EdaO54693 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EdaO54693 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EdaO54693 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EdaO54693 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EdaO54693 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EdaO54693 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EdaO54693 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EdaO54693 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EdaO54693 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EdaO54693 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EdaO54693 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EdaO54693 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EdaO54693 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EdaO54693 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EdaO54693 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EdaO54693 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EdaO54693 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EdaO54693 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EdaO54693 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EdaO54693 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EdaO54693 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EdaO54693 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms