Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bnc1O35914 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms