Protein–RNA interactions for Protein: O35701

Matn3, Matrilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn3O35701 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Matn3O35701 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms