Protein–RNA interactions for Protein: O35181

Nrg3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrg3O35181 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrg3O35181 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms