Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Kcnk3O35111 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Kcnk3O35111 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Kcnk3O35111 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms