Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FANCAO15360 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FANCAO15360 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FANCAO15360 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FANCAO15360 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCAO15360 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCAO15360 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCAO15360 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCAO15360 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCAO15360 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCAO15360 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCAO15360 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCAO15360 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCAO15360 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCAO15360 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCAO15360 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCAO15360 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCAO15360 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCAO15360 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCAO15360 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCAO15360 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCAO15360 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCAO15360 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCAO15360 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCAO15360 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCAO15360 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCAO15360 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCAO15360 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCAO15360 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCAO15360 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCAO15360 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCAO15360 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms