Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm17577J3QNF7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm17577J3QNF7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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