Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Igkv1-99F6XWB2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms