Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm10477F6SW83 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm10477F6SW83 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10477F6SW83 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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