Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp31E9Q6Y8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms