Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Myo5cE9Q1F5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5cE9Q1F5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms