Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms