Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd8B9EJ80 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms